Dimensionsreduktion für Personalisierte Medizin

Biologischer und medizinischer Hintergrund

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Krankenhaus
Personen Personen Personen Gruppe

Welche Patienten sind ähnlich?

Doktor

Welche Therapie ist die beste für welchen Tumorpatienten?

Tumor:

körpereigene Zellen mit genetischen Veränderungen

info
DNA

Genetische Analyse

info

Mutation

Tumor
GCTAGCAGC
Normal
GCTATCAGC

Genexpression

Gen-B
Gen-A

Datentabelle "Multi-Omics"

Mutation Expression
Gen1...Gen20123 Gen1...Gen20123
Patient 1 0
1
0
5
...
Patient 666 34 34

KI-Verfahren

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Personalisierte Medizin

Treatment
  • Gesundosin
  • Tumorfort
  • Krebsgehwegson

🔬 Genetik eines Tumors

Gen A Gen B Gen C reguliert

Ein Tumor bildet sich aus körpereigenen Zellen, wenn bspw. Umwelteinflüsse wie giftige Stoffe oder UV-Strahlung zu Mutationen in den Genen auslösen.
Das Mutationsmuster (* vs. *) ist dabei von Tumor zu Tumor immer unterschiedlich und bestimmt die Eigenschaften des Tumors in komplexer Weise, weil Gene sich untereinander regulieren.

🔬 Genetische Analyse

T G C A

Aktuelle Labormethoden können großskalig das gesamte Erbgut untersuchen durch Sequenzierung vieler einzelner Abschnitte der DNA. Aus diesen Millionen von kleinen DNA-Schnipseln (reads) kann durch bioinformatische Analysen bestimmen welche Stellen im Genom des Tumors mutiert sind. Weiterhin kann man die Schnipsel kartieren und „aufeinander legen“, so dass man die Häufigkeit der Gene in den Zellen bestimmen kann (Genexpression).

🔬 Genetik eines Tumors

Gen A Gen B Gen C reguliert

Ein Tumor bildet sich aus körpereigenen Zellen, wenn bspw. Umwelteinflüsse wie giftige Stoffe oder UV-Strahlung zu Mutationen in den Genen auslösen.
Das Mutationsmuster (* vs. *) ist dabei von Tumor zu Tumor immer unterschiedlich und bestimmt die Eigenschaften des Tumors in komplexer Weise, weil Gene sich untereinander regulieren.

🔬 Genetische Analyse

T G C A

Aktuelle Labormethoden können großskalig das gesamte Erbgut untersuchen durch Sequenzierung vieler einzelner Abschnitte der DNA. Aus diesen Millionen von kleinen DNA-Schnipseln (reads) kann durch bioinformatische Analysen bestimmen welche Stellen im Genom des Tumors mutiert sind. Weiterhin kann man die Schnipsel kartieren und „aufeinander legen", so dass man die Häufigkeit der Gene in den Zellen bestimmen kann (Genexpression).